Стук в двигателе  

Где конкретно слышен стук, в каком месте? Могут гидрокомпенсаторы стучать.

Этот стук глуше чем гидрокомпенсаторы

Бывает такое что распредвалы в пастелях люфтят издавая стуки. Износ постелей распредвала или банально ослабилась крышка постели. Вкладыши шатунные только через низ двигателя меняются, верх двигателя не трогаем. Много информации на drive2.ru можно найти вбивая в поиск тему.

Если застучат вкладыши это однозначно капремонт/проточка коленчатого и все такое/ ищите источник, причина может быть даже в корзине сцепления,

Глухой стук издаёт осевое смещение распредвала в пастелях. На ютюбе много видео выложено с такими глухими стуками - оказывается в итоге стучит распредвал глухим звуком. Стетоскопом надо послушать в каком месте двигателя стук. Карандаш в силиконовую или резиновую трубку вставить а трубку в ухо. Карандаш тычим во все места двигателя работающего и слушаем, выявляем точно откуда стук.

Согласен с nikolaes100, надо слушать распредвалы /про карандаш интересно/.

Можно и палку приложить...